1955年,軍隊將領阿蘭布魯發動政變,庇隆被迫流亡西班牙。阿蘭布魯政府擔心勞工組織利用埃娃的遺體聚眾生事,于是把遺體從總工會大樓轉移,藏了起來。根據英國廣播公司播出的紀錄片,埃娃的遺體放置地點可能包括布宜諾斯艾利斯一條街道旁停靠的貨車中、一塊電影屏幕的背后以及該市地下水道系統等。而且,可以肯定的是,遺體曾被存放在軍方的情報機構內。有記載稱,在輾轉于多個軍事機構后,埃娃的遺體到了一名少校軍官家中,他在自己的閣樓里用舊報紙把遺體覆蓋起來。但在這名少校神秘射殺自己的妻子后,遺體不得不再度轉移。

此時,勞工組織的抗議越來越激烈,他們要求看到埃娃的遺體。為避免遺體重現引發意外,當局決定將遺體送出國。1957年4月,在梵蒂岡教會人員秘密協助下,阿根廷軍方把埃娃的遺體送到前往意大利的一艘船上,接著用假名將遺體下葬在米蘭一處公墓。自此,“埃娃”遠離阿根廷,但她從未被忘卻。

1970年,一個名叫蒙特內羅的游擊組織綁架并殺死了阿蘭布魯將軍,因為他曾負責搬離埃娃的遺體。1971年,阿根廷再次發生政變。為換取流亡在外的庇隆支持,新上臺的拉尼斯將軍同意舉行大選,恢復庇隆的公民權,并將埃娃的尸體交還給他。于是,埃娃的尸體被挖了出來,裝到銀棺中,運到庇隆和其第三任妻子伊莎貝拉在馬德里的別墅。

阿根廷知名商人卡洛斯·斯帕多內是庇隆的心腹密友。1971年,他是在馬德里見到埃娃遺體的首批人士之一。他回憶說：“庇隆將軍、園丁和我共同將遺體從棺材中抬了出來。我們將它放在一個大理石桌子上,我們的手沾上了土,尸體也必須清洗。伊莎貝拉很細心地用棉布和水完成了這項工作。她為埃娃的遺體梳理頭發,一點一點地清理,并用吹風機吹干。這花了她幾天時間。”埃娃的遺體還被發現一根手指出現殘缺,應該是1955年那場政變之后弄掉的,因為軍官們想要確認它的確是埃娃的尸體。斯帕多內還說,尸體曾被多次擊打過：“鼻子上有個大坑,臉部和胸部有被擊打的痕跡,背部也有痕跡。一個膝蓋有嚴重受損的跡象,但我不認為她的尸體像某些人說的那樣曾被鞭打,我不相信。”但整體上看,盡管已經過去19年,埃娃的遺體仍然很完好。