不過龐教授對出兵也有自己的顧慮, 因為他說他不覺得 “中國的海軍已經具備了遠洋長期作戰應對非傳統安全的能力”。他認為在印度洋上加油、補給，對沒有遠洋作戰的中國海軍來說基本上都是新問題和挑戰。
然而,來自海軍智囊團的學者卻不大認可龐教授對中國海軍遠洋打擊海盜能力的質疑。關于遠洋補給的問題, 海軍的兩支艦艇在2002年就用4個月的時間完成了環球航行。另外,中國在過去幾年中也曾經參加過遠洋聯合軍事演習。來自海軍某研究所的李杰教授認為這些事例都證明了中國海軍擁有足夠的實力來完成這次打擊海盜的任務。
不過李杰教授卻對這種聯合軍事行動的效果提出了質疑。因為僅僅是亞丁灣的總面積約18萬平方公里,相當于我國渤海面積的兩倍多。李教授說：“在如此大的海域中高聯合軍事活動，指揮與交流會是比較大的問題。” 其實，對歐盟聯合軍事行動的質疑從一開始就一直沒有停止過。有很多學者人為索馬里海盜問題的根源不是在海上，而是在陸地上。索馬里是東非最貧窮的國家之一，經濟十分落后。自1991年1月，西亞德巴雷政權被推翻后，這個非洲之角的國家就陷入了徹底的無政府狀態，各地被不同派 系、不同部族的武裝組織割據，相互之間混戰不斷。在這里從事正當職業獲利艱難，而海盜們往往可以從船主或當事國那里獲得巨額贖金。從過去發生的案例來看，索馬里海盜每劫一艘船平均可以獲得100萬美元左右的贖金， 最近獲釋的幾艘外國船只交納的贖金已經平均高達200萬美元。
“沒有一個強有力的政府，卻擁有長長的海岸線、沙灘，和絕望的人民，索馬里為海盜業的興盛提供了完美的環境，”一份來自倫敦國際問題研究所最新發布的名為《索馬里海盜業》的報告如是說。該報告還提到，在過去的十年中，海盜業僅在2006年下半年當伊斯蘭法庭聯合會控制了索馬里時短暫地消失過。
然而當伊法聯在2006年底被與其對立的臨時政府在埃塞俄比亞軍隊的支持下打敗的時候，海盜業立刻重現并逐漸走到了今天的地步。而這份來自倫敦的報告指出：“事實上，海盜起源的普特蘭地區(Puntland)正是先在索馬里臨時政府總統阿卜杜拉希-尤素福（Abdullahi Yusuf）的老家”。
因此，索馬里鄰國吉布提共和國外長馬赫穆德-阿里-尤素福（Mahmoud Ali Youssouf）在近期接受一家沙特媒體的采訪中認為“索馬里海盜問題的根源在于其國內政治形勢與安全形勢的惡化”。他還表示作為索馬里的鄰居，吉布提已經為索馬里政府和反對者之間啟動了一輪協商，并且總體上達成了建立聯合政府和過度議會的正式協定。“之后，一個新的總統就可以被選出了，”吉布提外長說。
