（四）降低偏高的通行費收費標準。對通行費標準偏高、經營收益過高、社會反映集中的收費公路，由省級人民政府組織有關部門，按照經營性公路收回投資并有合理回報、政府還貸公路按期還貸并滿足養護管理資金需求的原則降低通行費收費標準。同時，完善公路計重收費辦法,確保合法裝載車輛通行費負擔有所減輕。
（五）對未按照有關法律、法規規定的權限和程序，將政府還貸公路改為經營性公路進行建設和經營管理的，要立即糾正，實現屬性歸位。
（六）對違反國家有關法律、法規規定，擅自在公路上設卡實施檢查或收費的行為，要堅決予以取締并嚴格追究相關人員的法律和行政責任。
（七）對各地出臺的有關收費公路方面的地方性法規和規范性文件進行清理，全面解決現行法規制度中明顯不適應實際需要、前后規定不一致或不銜接、文件過期等問題，確保在2012年4月底前完成相關地方性規章和規范性文件的修訂或廢除工作，同時提出修改完善相關行政法規的建議。
四、實施步驟
專項清理工作分四個階段進行：
第一階段，調查摸底階段（2011年6月20日—8月31日），各省級人民政府組織交通運輸、發展改革（價格）、財政等部門，按照工作職責及本通知要求，全面清查和核實截止到2011年4月30日仍在運行的所有收費公路項目的里程規模、站點設置、收費期限、收費標準等有關情況，按照附表要求填報收費公路專項摸底調查表并同時提供批復文件等相關證明材料，確保填報內容真實、全面，數據準確、翔實。各省、自治區、直轄市收費公路專項摸底調查表務必于2011年9月5日前報送交通運輸部（公路局）、發展改革委（價格司）、財政部（綜合司）。
第二階段，自查自糾階段（2011年9月1日—12月31日），各省、自治區、直轄市人民政府組織交通運輸、發展改革（價格）、財政等部門，在調查摸底的基礎上，按照相關政策法規和本通知的要求，對現有收費公路、收費期限、收費標準、收費站（點）和收費行為逐一進行審核。對審核發現的各類違規及不合理收費行為、收費項目及收費站（點），提出具體的整改措施，并在省級人民政府統一組織下抓好整改落實。
第三階段，檢查復核階段（2012年1月1日—2月29日），交通運輸部、發展改革委、財政部、監察部和國務院糾風辦將對各地調查摸底、自查自糾以及整改措施落實等有關情況進行督導和檢查，必要時組織省際互查。對清理工作不到位或存在弄虛作假、敷衍塞責等行為的地區和單位，將予以通報批評，并責令限期整改；情節嚴重的，依法追究相關人員的責任。
第四階段，總結完善階段（2012年3月1日—5月31日），各省、自治區、直轄市要認真總結本地區專項清理工作情況，并于2012年4月10日前將本地區專項清理工作總結等有關情況報送交通運輸部、發展改革委、財政部、監察部和國務院糾風辦。交通運輸部會同有關部門全面總結各地專項清理工作情況，并上報國務院。有關部門要按照職責分工研究提出規范收費公路發展的長效措施，進一步完善收費公路通行費標準形成機制，科學確定經營性公路合理回報率，建立健全政府還貸公路收支情況定期審計制度、收費公路統計制度和監測制度，制定收費公路信息公開辦法，強化收費公路服務質量監管力度，完善收費公路相關法規，通過完善制度、理順體制、優化機制、強化監管等措施，從根本上確保收費公路科學發展、規范管理。
